以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香配音）、小刚（うえだゆうじ配音）和小光（豊口めぐみ配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい配音）、凯宾（岸祐二配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难……本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：仲村宗悟 笠间淳 木村昴 神尾晋一郎 三宅健太 岩崎谅太 坂本真绫 濑户麻沙美 宝龟克寿 小林亲弘 梶原岳人 岛袋美由利 久野美咲 园崎未惠 松田健一郎 武内骏辅 奈良彻 长谷川芳明 鹿糠光明 岩城泰司 真木骏一
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演员：草尾毅 绿川光 梁田清之 置鲇龙太郎 盐屋翼 原惠理子 平松晶子 田中秀幸 小野坂昌也 神奈延年 西村知道 森川智之 干本雄之 盐屋浩三 佐藤正治 江川央生 川津泰彦 大塚芳忠 石川英郎
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演员：绪方惠美 林原惠美 宫村优子 坂本真绫 三石琴乃 山口由里子 山寺宏一 石田彰 立木文彦 清川元梦 长泽美树 子安武人 优希比吕 关智一 岩永哲哉 岩男润子 麦人 丸山咏二 西村知道 宇垣秀成 中博史 佐久间玲 山崎和佳奈 野田顺子 大原沙耶香 世户沙织 大川透 小野冢贵志 滝知史 室园丈裕 杉崎亮 茂木隆盛 山村响 藤本隆弘 岛田知美 入江崇史 金丸淳一
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